1、血清蛋白电泳
新鲜血清经电泳后可地描绘出患者蛋白质的全貌，有助于许多临床疾病判断的参考，在各类教材书上已清晰的描述了各种病理现象所显现的图像，一般常见的是白蛋白降低，某个球蛋白区域升高，提示不同的临床意义。如球蛋白多克隆(poly-clonal)增高，β-γ融合的桥连现象，在γ区呈现细而密的寡克隆(oligoclonal)区带，及由单一克隆浆细胞异常增殖所产生的单克隆(monoclonal)免疫球蛋白区带，又称M蛋白(Monoclonal Protein)带，血清蛋白电泳是其实验诊断方法。
血清蛋白电泳目前常用的检查方法是醋酸纤维膜电泳法。
2、免疫固定电泳
血清免疫固定电泳(Immunofixation, IF)技术是血清蛋白质在琼脂糖凝胶介质上经电泳分离后，应用蛋白质固定剂和各型免疫球蛋白及其轻链抗血清，加于凝胶表面的泳道上，经孵育和扩散后，若有对应的抗原存在，则在适应位置形成抗原抗体复合物并沉淀下来。染色后蛋白质电泳参考泳道和抗原抗体沉淀区带被氨基黑着色，根据电泳移动距离分离出单克隆组份，可对各类免疫球蛋白及其轻链进行分型。血清免疫固定电泳技术用于M蛋白的型、亚型和轻链型，本周(Bence-Jonse)蛋白和游离轻链的分型和鉴别。
3、同工酶电泳
血清乳酸脱氢酶同工酶电泳
血清肌酸激酶及其亚型同工酶电泳
血清碱性磷酸酶同工酶电泳
血清碱性磷酸酶同工酶电泳具有三种不同结构的基因编码或在转移后修饰的结果，按其氨基酸序列可分为小肠型、胎盘型和组织非特异型(肝、肾、骨)，它们各自表达产物可在血清中呈现，具有不同的意义。利用麦胚凝集素(wheat germ agglutinin, WGA)与ALP-L1和ALP-B糖链亲和力的不同，血清与WGA作用再经电泳后可将ALP同工酶予以分离。肝外胆道阻塞转移肝癌时，高分子ALP(ALP-L2)明显增高，在原发性肝癌时肝型ALP(ALP-L1)明显增高，骨转移性癌时ALP-B增高。
4、脂蛋白电泳
应用自动电泳系统可将血清中脂蛋白组份进行分离，呈现LDL、VLDL和HDL条带，输入TC值，计算各种脂蛋白中胆固醇含量，LDL-C/HDL-C比值在正常人群组与冠心病患者组存在显著差异(p<0.001);诊断临界值(cut-off point)为3.89，诊断灵敏度76.7%，特异性79.8%。LDL-C/HDL-C比值是粥样硬化性冠脉疾病重要的危险因子之一，明显优于胆固醇或其它血脂的单个含量指标，且随比值的增加，患冠脉疾病的危险性相应增大。
在凝胶中脂蛋白的等电点不同，不仅可区分α,前β和β区带，又因介质中含有抗LP(a)抗体及阳离子存在，抗LP(a)抗体与患者血清中LP(a)结合形成复合物，阳离子则抑制其它脂蛋白的泳动速度，LP(a)便与其它脂蛋白分离开来。清晰的LP(a)条带呈现在前β与γ区域之间，阳性条带扫描后，可获得区带的面积及其百分含量，提高了对心、脑血管独立的危险因子LP(a)检测的敏感性和特异性。
5、血红蛋白电泳
血红蛋白电泳可使正常血红蛋白HbA与HbA2分离，也可检测出大部分异常血红蛋白如:HbS、HbD、HbC和HbE。当HbA2、HbC和HbE>20%时，则难以分离和鉴别。应先用碱性琼脂糖凝胶血红蛋白电泳进行正常和异常血红蛋白的分离和检测，通常用于孕妇的筛选，然后再进行酸性琼脂糖凝胶血红蛋白电泳，对异常血红蛋白予以分离和鉴别。
血红蛋白遗传性分子病常分为异常Hb病和地中海贫血两大类。异常Hb病如镰状细胞贫血，在碱性缓冲液中异常HbS电泳区带的位置呈现在HbA与HbA2之间，异常血红蛋白的HbC和HbE电泳迁移率都十分缓慢，HbC和HbA2可重叠。在PH6.2的枸橼酸缓冲液的是琼脂糖介质电泳中，由于HbC不能与HbA分离，这样就可检测出HbE。异常血红蛋白HbD是在碱性缓冲液中其电泳迁移率如同HbS，而在PH6.2枸橼酸缓冲液的琼脂糖介质中，因HbS与HbA不能分离，这样就可以分离和检测出HbD。β-地中海贫血是HbA的合成受损，电泳图谱可呈现HbA2与HbF区带。
